根據男性和女性角度的不同，漫畫排名也有差異，下面是男性喜歡的日本漫畫排行榜2016與女性喜歡的日本漫畫排行榜2016。
男性喜歡的日本漫畫排行榜2016：
第一名 《迷宮飯》九井諒子
第二名 《黃金神威》野田サトル
第三名 《黑博物館》藤田和日郎
第四名 《戀如雨止》眉月じゅん
第五名 《我的英雄學院》堀越耕平
女性喜歡的日本漫畫排行榜2016：
第一名 《阿宅的戀愛太困難》ふじた
第二名 《東京白日夢女》東村明子
第三名《町田君的世界》安藤ゆき
第四名 《鹽田老師和雨井醬》なかとかくみこ
第五名 《翱翔天際的夜鷹》川端志季
日本漫畫排行榜2016【總榜單】
第1位：《迷宮飯》【作者：九井諒子】(ダンジョン飯)
第2位：《黃金神威》【作者：野田サトル】(ゴールデンカムイ)
第3位：《黑博物館 幽靈和淑女》【作者：藤田和日郎】(黒博物館 ゴースト&レディ)
第4位：《戀如雨止》【作者：眉月じゅん】(戀は雨上がりのように )
第5位：《我的英雄學院》【作者：堀越耕平】(僕のヒーローアカデミア)
第6位：《海浪,請聽我說》【作者：沙村廣明】(波よ聞いてくれ)
第7位：《工作細胞》【作者：清水茜】(働く細胞)
第8位：《獻給岡崎》【作者：山本さほ】(岡崎に捧ぐ)
第9位：《粗點心戰爭》【作者：琴山】(だがしかし)
第10位：《只有我不在的街道》【作者：三部敬】(僕だけがいない街)
第11位：《弟之夫》【作者：田龜源五郎】(弟の夫)
第12位：《響~成為小說家的方法~》【作者：柳本光晴】(響 -小説家になる方法-)
第13位：《陸地》【作者：山下和美】(ランド)
第14位：《Angolmois元寇合戰記》【作者：高木七彥】(アンゴルモア -元寇合戦記-)
第15位：《藍巨星》【作者：石冢真一】(BLUE GIANT)
第16位：《魔法使的新娘》【作者：ヤマザキコレ】(魔法使いの嫁)
第17位：《特攝GAGAGA》【作者：丹羽庭】(トクサツガガガ)
第18位：《滅世Demolition》【作者：淺野一二O】(デッドデッドデーモンズデデデデデストラクション)
第19位：《PLINIVS》【作者：ヤマザキマリ】(プリニウス)
第20位：《白暮編年史》【作者：ゆうきまさみ】(白暮のクロニクル)